İnsanların anonim bir şekilde sırlar paylaşabilmesine olanak sağlama hedefi olan Whisper, bu amacında pek başarılı değil gibi gözüküyor. Yayınlanan bir Guardian raporuna göre kullanıcıların güvenliğini ve gizliliğini büyük ölçüde tehlikeye atan uygulama takip edilmek istemeyen kullanıcıların bile lokasyon bilgisine erişiyor ve sunucularında tutuyor. Raporda ayrıca Whisper’ın bu verileri Amerikan Savunma Bakanlığı ile paylaştığına dikkat çekiliyor. Whisper tarafından yapılan açıklama göre Whisper herhangi bir veri topluyor değil ancak Guardian raporun yayınlanmasının 4 gün sonra Whisper’ın kullanım koşulları sözleşmesini yenilediğine dikkat çekiyor. Ek olarak anonim paylaşımlarının bir süre sonra sistemden silineceğini düşünen kullanıcıların aksine Whisper 2012 yılından bu yana tüm gönderilerin tutulduğu ortaya konuluyor.