1998, 1999, 2000 Türkiye Gazeteciler Cemiyeti Yılın Ekonomi Muhabiri Ödülü
1998 Metin Göktepe Gazetecilik Ödülü
2002 Sedat Simavi Gazetecilik Ödülü
2007 Çağdaş Gazeteciler Derneği Uğur Mumcu Araştırmacı Gazetecilik Ödülü
2009 Türkiye Gazeteciler Cemiyeti Basın Özgürlüğü Ödülü
2010 Abdi İpekçi Yılın Gazetecilik Ödülü
2010 Kemal Sunal Kültür ve Sanat Ödülleri En İyi Yazar Ödülü
2010 Türkiye Yayıncılar Birliği Düşünce ve İfade Özgürlüğü Ödülü
2010 Uluslararası Basın Enstitüsü (International Press Institute) Basın Özgürlüğü Kahramanı
2010 PEN İfade Özgürlüğü Ödülü
2012 Kutlu Adalı Onur Ödülü
2013 Gazetecileri Koruma Komitesi (CPJ) Uluslararası Basın Özgürlüğü Ödülü
2015 Leipzig Basın Özgürlüğü ve Medyanın Geleceği Ödülü