Mustafa Çiftçi, 1980 yılında Konya’nın Çumra ilçesinde dünyaya geldi. 1995 yılında Ankara Siyasal Bilgiler Fakültesi (Mülkiye) Kamu Yönetimi bölümünü bitirdi.
Selçuk Üniversitesi ve Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi'nde iki ayrı yüksek lisans çalışması tamamladı. Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi, Anadolu Üniversitesi İktisat Fakültesi ve Adalet bölümünü bitiren Çiftçi’nin, Ankara Üniversitesi Hukuk Fakültesi ve Anadolu Üniversitesi Tarih bölümünde kaydının olduğu iddia edildi.
Yeni İçişleri Bakanı Mustafa Çiftçi, Gülağaç, Tekman, Derinkuyu, Adilcevaz ve Kaman ilçelerinde kaymakamlık yaptıktan sonra İçişleri Bakanlığı Personel Genel Müdürlüğü’nde Daire Başkanlığı, TBMM’de Özel Kalem Müdürlüğü ve Başkan Başmüşavirliği gibi stratejik görevlerde bulundu.
Mustafa Çiftçi’nin ilk valilik görevi ise Çorum’da oldu. Çiftçi, 2023’te Erzurum Valisi olarak atandı.
Evli ve üç çocuk babası olan Mustafa Çiftçi, İngilizce ve Arapça bilmektedir.