Josef Breuer 1858 yılında Viyana Akademisches Gymnasium'dan mezun olmasının ardından Viyana Üniversitesi tıp fakültesine kaydını yaptırmadan önce bir yıl üniversitede okudu . 1867'de tıp sınavlarından geçer not aldı ve üniversitede dahiliyeci Johann Oppolzer'in asistanı olarak göreve başadı.