1972 yılında İstanbul'da dünyaya gelen Hakan Altun aslen Siirtlidir. 'Arap Hasan' lakaplı futbolcu Hasan Altun'un oğlu olan Hakan Altun'un bir de kız kardeşi vardır. Lisans eğitimini İstanbul Teknik Üniversitesi Türk Musikisi Devlet Konservatuarı'nda yapan Hakan Altun, yüksek lisans eğitimini İstanbul Teknik Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü'nde tamamlamıştır.
1994 yılında, Edirne Türk Devlet Müziği topluluğunda çalışan Hakan Altun 1997'de görevini bırakarak vatani görevini yapmak için askere gitti. Askerliğini yaptığı Ankara'da besteci yönünü keşfeden Hakan Altun, 1998 yılında kendi adını taşıyan ilk albümünü çıkardı. Sevilen sanatçı ilk albümündeki 'Hani Bekleyecektin' adlı şarkısı ile o dönem büyük bir çıkış yakalamıştır.
2000 yılında 'Ağlamak Yok Yüreğim' adlı ikinci albümünü çıkaran Altun'un, ikinci albümünün çıkış parçası 'Ağlamak Yok Yüreğim'dir. Bu albümde yer alan 'Her Sevda Bir Ölümmüş' adlı şarkısına Şebnem Schaefer ile çektiği video klibi ile ses getirmiştir.
Birçok usta sanatçı ile birlikte çalışan ve bestelere imza atan Hakan Altun ud, cümbüş, gitar ve klavye çalmaktadır. Hakan Altun müzikal çalışmalarına devam etmektedir.
Gonca Vuslateri ile beraber olan Hakan Altun bir süre önce ayrıldığını açıklamıştı. Ayrıca Hakan Altun 2008 yılında beyin tümörü ameliyatı geçirdi. Ameliyattan sonra 12 yıl beyin tümörü ile yaşadığı öğrenildi.