Geç döllenmenin net bir nedeni bulunmamakla birlikte bu durum aşağıdaki bazı nedenlerden etkilenebilir;
Polikistik Over Sendromu: Yumurtalıklardaki bazı oluşumlar bedenin hormon seviyelerini bozar ve yumurta salınımını etkileyebilir. Ayrıca polikistik over sendromu bulunan bazı kadınlarda yumurtalama tamamen ortadan kalkabilir.
Tiroit Bozuklukları: Bozulan hormon tiroit seviyeleri ve yumurtlama dönemini düzensizliğe uğratabilir.
Prolaktin Yüksekliği: Prolaktin seviyelerinin artması beraberinde östrojen hormonunda dengesizliklere yol açar. Östrojen düşüklüğü ise yumurtlama dönemini olumsuz etkileyen bir faktördür.
İlaçlar: ilaçların yan etkisi olarak yumurtlama sisteminde sorunlar oluşabilir. Bu sebeple gebelik planlayan kadınlar kullandığı ilaçlar hakkında doktorunu bilgilendirmelidir.
Stres: Stres hormon seviyelerinin dengesini doğrudan etkileyebilir. Düzensiz salgılanan hormonlar yumurtlamaya etki ederek geç döllenmeye sebep olabilir.
Doğum Sonrası Süreç: Hamileliğin sona ermesinin ardından 3 ay sonra yaşanan düşük ya da kürtaj geç döllenmeye neden olabilir.