Çocuklarda karın ağrılarının yaygın nedenleri arasında kronik kabızlık, mide-bağırsak enfeksiyonları ve parazitler yer alır. Çocukların ağrıları tarif etmesi oldukça zordur. Karın ağrısı olarak tanımladıkları şikayetler bazen böbrekler, idrar yolu veya mesane ile alakalı sorunlardan da ortaya çıkabilir. İç hastalıklarına bağlı gelişen bu tip ağrılar anlık olmayan kronik ağrılardır.
Çocuklarda karın ağrılarının sebebi olarak birçok sağlık sorunundan söz etmek mümkündür. Bunlar;
Enfeksiyonlar: Gastroenterit, mesane ya da böbrek enfeksiyonları ya da göğüs ve kulak gibi vücudun farklı alanlarında oluşan enfeksiyonlar
Cerrahi sorunlar: Barsak tıkanıklığı, apandisit, ya da invajinasyon (bağırsaktaki ciddi bir tıkanıklık)
İrttitabl bağırsak sorunları: Kolik ya da kabızlık
Yiyecekle alakalı sorunlar: Yemeyi fazla kaçırma, yiyecek alerjisi ya da zehirlenme
Ailevi Akdeniz Ateşi kalıtsal bir hastalık olup en önemli bulgusu karın ağrısı şikayetidir.
Kız çocuklarında adet dönemi öncesi ağrılar ortaya çıkabilir.
Kışın rotavirüs pek çok çocukta karın ağrısına sebep olabilmektedir.
Apandist öyküsü bulunan kız çocuklarında karın içindeki yumurtalıklar karın ağrılarına neden olabilir.