Müze içerisinde, Bandırma Vapuru'nun orijinal hali gibi, 18 kişilik mürettebatın yaşam alanlarını görme şansına sahipsiniz. Ayrıca, geminin ambarında yer alan ve Kurtuluş Savaşı'nın çeşitli evrelerini anlatan diorama sergileri de bulunmaktadır. Bu sergiler, ziyaretçilere tarihi bir yolculuk yaşatır.
Müze ziyaretiniz sırasında, Atatürk ve silah arkadaşlarının Samsun'a yaptığı tarihi yolculuğu adım adım takip edebilirsiniz. Geminin kaptan köşkünden itibaren, Atatürk'ün kabinine, daha sonra da geminin diğer bölümlerine geçiş yapabilirsiniz. Her adımda, geminin ve yolculuğun önemli anılarına tanık olacaksınız.
Müzede, Bandırma Vapuru dışında da birçok ilginç sergi bulunmaktadır. Bunlar arasında, Samsun'un tarihini anlatan fotoğraf galerisi ve Kurtuluş Savaşı'na dair belgeler bulunmaktadır. Ayrıca, Atatürk'ün Samsun'a ilk adımını attığı anı canlandıran bir heykel de müze içerisinde yer alır.