1963 yılında Ayetullah Humeyni önderliğindeki İslami Hareket'e katılan Hamaney, 1979 İran İslam Devrimi'nde aktif rol aldı. Devrim sonrası İslam İnkılabı Yüksek Şurası üyeliğine atanan Hamaney, 1979 yılında İran'da Savunma Bakan Yardımcısı olarak görev yaptı.
1980 yılında İran-Irak Savaşı'nda görev aldı ve 27 Haziran 1981 tarihinde Ebuzer Camisi'ne yapılan bombalı saldırıda ağır yaralandı. Dönemin Cumhurbaşkanı Muhammed Ali Recai'nin bir bombalı saldırıda hayatını kaybetmesiyle birlikte 1981 yılının Ekim ayında yapılan seçimlere katıldı.
Seçimlerde 16 milyon oy alan Hamaney, İran'ın üçüncü cumhurbaşkanı oldu. Daha sonra İran'ın dini liderliğine yükseldi ve halihazırda bu görevini sürdürmektedir.